使用不同公司的粪污发酵剂产品发酵后，粪污表面有的会产生明显的菌丝，而有的却没有。
      有的客户认为，能够产生菌丝的发酵效果会更好，但往往是一种误区。是否产生菌丝是和发酵采用的菌种有直接关系，但不能用来衡量发酵效果的好坏。
　　粪污发酵过程中，主要采用的菌种有枯草芽孢杆菌、乳酸菌、酵母菌、放线菌及丝状真菌等。采用枯草芽孢杆菌主导的好氧发酵是常用的发酵方法，这种发酵工艺代谢速率相对较快，产生大量热，对于粪污中存在的有害寄生虫，可以起到有效的杀灭作用，另外发酵产生的细菌素还可以杀灭粪污中的腐败菌，有效去除氨味。
　　但枯草芽孢杆菌在发酵过程中是不会出现菌丝的，采用产朊假丝酵母、白腐菌及米曲霉等丝状真菌主导的发酵就会产生菌丝。所以，发酵效果的好坏不能仅根据是否有菌丝来判定，而是应该根据粪便发酵温度的升高快慢、除臭效果、寄生虫数量、有害菌数量等指标来判断发酵的效果。